去年國內鬧蛋荒之時，畜產會受農業部委託向國外進口雞蛋，但審計部披露，當時農業部專案計畫還沒核定，僅憑LINE的訊息畜產會就著手辦理雞蛋進口作業，不符合作業規範。對此，新北市長侯友宜受訪被問及此事表示，人民最需要的是一個清楚的答案，希望透過公平、公開方式，公諸讓人民知道。
據審計部公布「2023年度中央政府總決算」，其中有關進口雞蛋爭議部分指出，農業委員會（後改制為農業部）為因應2023年國內雞蛋產能降低供不應求，補助畜產會辦理「2023年度雞蛋緊急調度計畫」及追加計畫，補助經費共8億1801萬餘元，進口雞蛋填補國內市場供需缺口。
農業部去年委託中央畜產會以專案進口方式，自巴西、日本等地採購1億5千多萬顆雞蛋，審計部最新出爐的報告揭露多項行政缺失。審計部指出，農業部在專案計畫沒有核定以前，只以LINE訊息或函文通知畜產會辦理雞蛋進口作業，請畜產會先用自有資金墊付，是採購作業程序有問題。
審計部還指出液蛋加工與倉儲作業、雞蛋洗選廠商效期標錯等多項缺失。農業部長陳駿季表示，畜產會的流程是有很多必須改善，農業部也已進行相關檢討，強化後續行政程序。
